Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd11Q6NS46 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms