Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms