Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Smarca2Q6DIC0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Smarca2Q6DIC0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms