Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11bQ6DFW5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms