Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms