Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzrn3Q69ZS0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzrn3Q69ZS0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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