Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spty2d1Q68FG3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms