Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms