Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BegainQ68EF6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BegainQ68EF6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms