Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3ipQ68EF0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3ipQ68EF0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms