Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp4eQ66X19 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms