Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80dQ66JY2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms