Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnna3Q65CL1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms