Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Clcn1Q64347 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Clcn1Q64347 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clcn1Q64347 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms