Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf4Q64310 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms