Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf1Q64213 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf1Q64213 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms