Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zic2Q62520 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms