Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms