Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20809Q62458 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Gm20809Q62458 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm20809Q62458 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20809Q62458 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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