Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20917Q62457 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20917Q62457 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms