Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt6hQ62383 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms