Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TrhQ62361 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrhQ62361 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms