Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim28Q62318 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Trim28Q62318 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Trim28Q62318 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Trim28Q62318 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim28Q62318 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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