Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan7Q62283 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan7Q62283 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms