Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SnrpcQ62241 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SnrpcQ62241 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SnrpcQ62241 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SnrpcQ62241 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnrpcQ62241 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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