Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sin3bQ62141 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sin3bQ62141 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms