Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msi1Q61474 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms