Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms