Protein–RNA interactions for Protein: Q61115

Ptch1, Protein patched homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch1Q61115 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptch1Q61115 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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