Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxf1Q61080 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxf1Q61080 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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