Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc1Q61056 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trpc1Q61056 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc1Q61056 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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