Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TmpoQ61033 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms