Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Scarb1Q61009 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scarb1Q61009 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb1Q61009 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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