Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxg1Q60987 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms