Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms