Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JrkQ60976 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JrkQ60976 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms