Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms