Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RelnQ60841 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelnQ60841 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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