Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp1r1bQ60829 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp1r1bQ60829 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms