Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf3Q60765 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms