Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms