Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcf4Q60722 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcf4Q60722 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms