Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms