Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClpbQ60649 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms