Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm1Q60636 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm1Q60636 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms