Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CttnQ60598 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms