Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rabl6Q5U3K5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rabl6Q5U3K5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms