Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Psme4Q5SSW2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms