Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sft2d1Q5SSN7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms