Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Utp18Q5SSI6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Utp18Q5SSI6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Utp18Q5SSI6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms